ابتدا نرم افزار Thonny را از وبسایت رسمی آن دانلود و نصب کنید. Thonny یک محیط توسعه Python راحت برای کار با میکروکنترلرهای مانند RP2040 ارائه می‌دهد. پس از نصب Thonny، برد RP2040 خود را از طریق پورت USB به کامپیوتر خود وصل کنید. Thonny باید برد RP2040 را تشخیص دهد و در پنجره "Python Shell" نمایش دهد. از وبسایت رسمی MicroPython فایل firmware مورد نظر خود را برای RP2040 دانلود کنید.

این فایل به صورت یک فایل UF2 در دسترس است.در Thonny، بر روی "File" کلیک کرده و "Open" را انتخاب کنید. سپس مسیر فایل firmware UF2 را انتخاب کنید. پس از انتخاب فایل، در برگه "Device"، پورت مربوط به RP2040 را انتخاب کنید.با کلیک بر روی "Run" یا "Flash"، Thonny firmware را بر روی RP2040 نصب خواهد کرد. این عملیات ممکن است مدتی طول بکشد. به طور خودکار، برد RP2040 دوباره راه‌اندازی می‌شود و firmware جدید نصب می‌شود.پس از نصب firmware، می‌توانید از پنجره "Python Shell" در Thonny یا از یک ترمینال سریال دیگر برای اتصال به RP2040 و اجرای دستورات خود استفاده کنید.